Un día en el pacífico Reino TECNOChampiñón, en el colegio Santo Ángel, el Rey Bowser, líder de la tropa Koopa, invade el Reino TECNOChampiñón y convierte a todos sus habitantes en bloques, ítems, enemigos y otras cosas extrañas. La única persona que podía devolver a la normalidad el reino era la Princesa Peach, Bowser conociendo eso, secuestra a la princesa. Mario y Luigi dándose cuenta del caso, empiezan una aventura recorriendo los TECNOmundos del Reino hasta llegar a el Castillo de Bowser, derrotarlo y salvar a la Princesa Peach y que todo el reino vuelva a la normalidad.
Mario y Luigi para llegar a donde se encuentra Bowser, tienen que avanzar por varios TECNOmundos donde se encuentran diferentes niveles, que contienen pruebas y enemigos que al ir superandolos se convierten en recompensas. Al superar cada TECNOmundo, podrás avanzar al siguiente. Si por alguna razón el tiempo termina, y Mario o Luigi no han superado el TECNOmundo automáticamente perderán una vida y tendrán que volver a superar el nivel.
En el último nivel de cada TECNOmundo, se encuentra un Castillo de Bowser, donde deberán enfrentarse al Guardián del castillo y superar la prueba final para obtener un nuevo rango de poder y habilidad.
Tu objetivo será ayudar a Mario y Luigi a superar los 4 TECNOmundos y alcanzar al menos el rango FLOR para superar el mundo de la Tecnología, o el rango ESTRELLA si te has convertido en una SUPER ESTRELLA DE ESTOS MUNDOS, con el podrás obtener un sobresaliente. ¡Ánimo, al final del curso solo los mejores equipos podrán participar en el BREACKING OUT, para liberar a la princesa Peach del malvado Bowser, nos vemos al final, espero que con la princesa liberada!